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Microbiologie (OpenStax) - Biologie

Microbiologie (OpenStax) - Biologie



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Microbiologie couvre la portée et les exigences de séquence pour un cours de microbiologie d'un semestre pour les non-majors. MicrobiologieLe programme d'art améliore la compréhension des concepts par les étudiants grâce à des illustrations, des diagrammes et des photographies clairs et efficaces.

Vignette : La bactérie Campylobacter est la principale cause de maladie gastro-intestinale bactérienne liée aux aliments aux États-Unis. (Domaine public ; De Wood, Pooley du Service de la recherche agricole).


2.4 Coloration des échantillons microscopiques

​Dans leur état naturel, la plupart des cellules et des micro-organismes que nous observons au microscope manquent de couleur et de contraste. Cela rend difficile, voire impossible, de détecter des structures cellulaires importantes et leurs caractéristiques distinctives sans traiter artificiellement les spécimens. Nous avons déjà fait allusion à certaines techniques impliquant des taches et des colorants fluorescents, et dans cette section, nous discuterons plus en détail des techniques spécifiques pour la préparation des échantillons. En effet, de nombreuses méthodes ont été développées pour identifier des microbes spécifiques, des structures cellulaires, des séquences d'ADN ou des indicateurs d'infection dans des échantillons de tissus, au microscope. Ici, nous nous concentrerons sur les techniques les plus pertinentes sur le plan clinique.


Septicémie bactérienne, choc septique et toxique

A de faibles concentrations, des cytokines pro-inflammatoires telles que l'interleukine 1 (IL-1) et le facteur de nécrose tumorale-α (TNF-α) jouent un rôle important dans les défenses immunitaires de l'hôte. Cependant, lorsqu'ils circulent de manière systémique en plus grandes quantités, la réponse immunitaire qui en résulte peut mettre la vie en danger. IL-1 induit vasodilatation (élargissement des vaisseaux sanguins) et réduit les jonctions serrées entre les cellules endothéliales vasculaires, entraînant une œdème. Au fur et à mesure que les fluides sortent de la circulation dans les tissus, la pression artérielle commence à chuter. Si rien n'est fait, la pression artérielle peut tomber en dessous du niveau nécessaire pour maintenir des fonctions rénales et respiratoires adéquates, une condition connue sous le nom de choc septique. De plus, la libération excessive de cytokines lors de la réponse inflammatoire peut conduire à la formation de caillot de sangs. La perte de tension artérielle et l'apparition de caillots sanguins peuvent entraîner une défaillance de plusieurs organes et la mort.

Les bactéries sont les agents pathogènes les plus courants associés au développement de la septicémie et du choc septique. 1 L'infection la plus courante associée à état septique est pneumonie bactérienne (voir Infections bactériennes des voies respiratoires), représentant environ la moitié de tous les cas, suivies des infections intra-abdominales (Infections bactériennes du tractus gastro-intestinal) et des infections des voies urinaires (Infections bactériennes du système urinaire). 2 Infections associées à des plaies superficielles, des morsures d'animaux et à demeure cathéters peut également entraîner une septicémie et un choc septique.

Ces infections localisées initialement mineures peuvent être causées par un large éventail de bactéries différentes, y compris Staphylocoque, Streptocoque, Pseudomonas, Pasteurella, Acinetobacter, et les membres des entérobactéries. Cependant, si elles ne sont pas traitées, les infections par ces agents pathogènes à Gram positif et à Gram négatif peuvent potentiellement évoluer vers une septicémie, un choc et la mort.


En tant que groupe d'organismes trop petits pour être vus et surtout connus pour être des agents de maladie et de mort, les microbes ne sont pas toujours appréciés pour les nombreuses contributions positives et positives qu'ils apportent au monde vivant. Conçu pour soutenir un cours de microbiologie, Microbiologie : une expérience de laboratoire permet d'avoir un aperçu à la fois du bon et du mauvais dans le monde microscopique. Les expériences de laboratoire sont conçues pour susciter et soutenir l'intérêt des étudiants pour la microbiologie en tant que sujet, domaine d'études et carrière. Ce texte propose une série d'exercices de laboratoire compatibles avec un cours de premier cycle en microbiologie ou bactériologie d'un semestre avec une période de laboratoire de trois ou quatre heures qui se réunit une ou deux fois par semaine. La conception du manuel de laboratoire est conforme aux directives du programme de l'American Society for Microbiology et adopte une approche de base - en commençant par une introduction aux pratiques de biosécurité et de confinement et à la façon de travailler avec les risques biologiques. À partir de là, le cours passe aux compétences de base mais essentielles en microscopie, à la technique aseptique et aux méthodes de culture, et se développe pour inclure des techniques de laboratoire plus avancées. Les exercices intègrent un projet de laboratoire d'investigation d'un semestre conçu pour promouvoir le sens de la découverte et encourager l'engagement des étudiants. Le programme est rigoureux mais gérable pour un seul semestre et intègre les meilleures pratiques en matière d'enseignement de la biologie.

Type de matériel : Activité/Laboratoire, Manuel


Manuels et diapositives de cours

    Manuel (OpenStax)*
    Un manuel dynamique pour le cours d'anatomie et de physiologie humaines de deux semestres pour les sciences de la vie et les sciences paramédicales. Le livre est organisé par système corporel et couvre les exigences de portée et de séquence standard. La version Web d'Anatomie et physiologie propose également des liens vers des vidéos chirurgicales, l'histologie et des diagrammes interactifs. Manuel PDF (Carlos Liachovitzky, CUNY Bronx Community College)
    L'objectif général de ce manuel de cours préparatoire est d'aider les étudiants à se familiariser avec certains termes et certains concepts de base qu'ils trouveront plus tard dans le cours d'anatomie et physiologie humaines I. L'organisation et le fonctionnement de l'organisme humain sont généralement discutés en termes de différents niveaux de complexité croissante, des plus petits éléments constitutifs à l'ensemble du corps. Ce cours préparatoire d'anatomie et de physiologie couvre les bases du niveau chimique et une introduction de base au niveau cellulaire, au niveau des organes et aux niveaux des systèmes d'organes. Il y a aussi une introduction à l'homéostasie au début. Cahier de texte*
    Manuel ouvert "conçu pour le cours d'introduction à la biologie typique pour les non-majors, couvrant la portée standard et les exigences de séquence. Le texte comprend des applications intéressantes et transmet les grands thèmes de la biologie, avec un contenu significatif et facile à comprendre. Le livre est conçu pour démontrer les concepts de la biologie et promouvoir la culture scientifique. Manuel (OpenStax)*
    “Biologie 2e
    est conçu pour couvrir la portée et les exigences de séquence d'un cours de biologie typique de deux semestres pour les majors scientifiques. Le texte fournit une couverture complète de la recherche fondamentale et des concepts de base de la biologie à travers une lentille évolutive. Il comprend des fonctionnalités riches qui engagent les étudiants dans la recherche scientifique, mettent en évidence les carrières dans les sciences biologiques et offrent des applications quotidiennes. Le livre comprend également divers types de questions pratiques et de devoirs qui aident les étudiants à comprendre et à appliquer les concepts clés. Ceci met à jour l'édition précédente.
  • Manuel de microbiologie (OpenStax)*
    «La microbiologie couvre la portée et les exigences de séquence d'un cours de microbiologie d'un semestre pour les non-majors. Le livre présente les concepts de base de la microbiologie en mettant l'accent sur les candidatures à des carrières dans le domaine de la santé paramédicale. Manuel (OpenStax) Manuel (OpenOregon)
    “Ce manuel ouvert couvre les problèmes environnementaux les plus importants, d'un point de vue biologique. Le texte est conçu pour un cours de sciences au niveau collégial d'introduction. Les sujets comprennent les principes fondamentaux de l'écologie, de la biodiversité, de la pollution, du changement climatique, de la production alimentaire et de la croissance de la population humaine.” Diapositives de conférence pour chaque chapitre.
  • Biofondamentaux – Université du Colorado
    Un cours d'introduction d'un semestre (évoluant en deux) sur les fondements des systèmes évolutifs, moléculaires, génétiques, génomiques et ampères de la biologie moderne. Se concentre sur le soutien expérimental de ce que nous savons de la biologie cellulaire et moléculaire. Écrit pour servir de cours d'introduction à la biologie pour les majeures en biologie avec des prérequis en chimie et en biologie au secondaire, ainsi que pour les cours de biologie cellulaire et moléculaire « passerelle » pour les étudiants ayant une formation de niveau collégial en biologie générale et en chimie générale. couvre la biologie cellulaire, la génétique, l'évolution, la physiologie, la maladie, la nutrition et l'écologie. Par CK-12, Jean Brainard, Ph.D., et Rachel Henderson, Ph.D.

*Les diapositives des conférences pour les livres OpenStax peuvent être obtenues en s'inscrivant en tant qu'instructeur chez OpenStax. Certaines de ces diapositives de cours sont également disponibles sur OERCommons.

Les 33 livres OpenStax sont également disponibles en version PressBooks sur BCcampus. Il existe également des adaptations d'OpenStax, Boundless (archivés par Lumen Learning) et d'autres livres et auxiliaires de biologie sur LibreTexts.


Matériel d'apprentissage ouvert GALILEO

Ce manuel de laboratoire ouvert est un remix d'Openstax Microbiology, CC-BY 4.0, et créé grâce à une subvention de transformation des manuels scolaires de Georgia Round Six.

Le manuel de laboratoire a été conçu pour être utilisé avec le manuel remixé Microbiology for Allied Health Students, et le manuel contient un ensemble de supports pédagogiques.

Ce manuel de laboratoire a été créé pour soutenir un cours de microbiologie pour les étudiants en sciences paramédicales.

La première section du manuel a été adaptée du manuel OpenStax Microbiology, dont une version remixée, Microbiology for Allied Health Students, est utilisée comme texte pour le cours.

La section suivante, les méthodes de coloration, englobe trois procédures de coloration essentielles utilisées dans tout laboratoire de microbiologie.

Le manuel se termine par des descriptions des principaux tests biochimiques que les étudiants doivent effectuer afin d'identifier un micro-organisme inconnu. Alors que de nombreux manuels de laboratoire traditionnels sont longs et complets, les descriptions des laboratoires dans ce manuel sont réduites au minimum pour encourager les étudiants à poursuivre leurs recherches sur les procédures et les résultats par eux-mêmes.

L'annexe comprend un contrat de sécurité que chaque étudiant doit signer et remettre au moniteur en début de semestre.

Ce manuel a été créé en partie grâce à une subvention de l'initiative de transformation des manuels scolaires en Géorgie du système universitaire de Géorgie. Un merci spécial à Sara Selby pour l'édition et la photographie.

Fichiers accessibles avec reconnaissance optique de caractères (OCR) et marquage automatique fournis par le Center for Inclusive Design and Innovation.


Matériel d'apprentissage ouvert GALILEO

Ce manuel ouvert est un remix d'Openstax Microbiology, CC-BY 4.0, et créé grâce à une subvention de transformation des manuels scolaires de Georgia Round Six.

Le manuel contient les documents supplémentaires suivants dans ce référentiel :

La microbiologie pour les étudiants paramédicaux est conçue pour couvrir la portée et les exigences de séquence du cours de microbiologie d'un semestre pour les étudiants non spécialisés et paramédicaux. Le livre présente les concepts de base de la microbiologie en mettant l'accent sur les candidatures à des carrières dans le domaine de la santé paramédicale. Les caractéristiques pédagogiques de Microbiologie pour les étudiants en médecine paramédicale rendent le matériel intéressant et accessible aux étudiants tout en maintenant l'orientation professionnelle et la rigueur scientifique inhérente à la matière.

La portée et la séquence de Microbiologie pour les étudiants en médecine paramédicale ont été développées et vérifiées avec la contribution de nombreux instructeurs d'institutions à travers les États-Unis. Elle est conçue pour répondre aux besoins de la plupart des cours de microbiologie des étudiants en médecine paramédicale.

Avec ces objectifs à l'esprit, le contenu de ce manuel a été organisé selon une progression logique des concepts fondamentaux aux concepts plus avancés. Les premiers chapitres présentent un aperçu de la discipline, avec des chapitres individuels axés sur la biologie cellulaire ainsi que chacun des différents types de micro-organismes et les différents moyens par lesquels nous pouvons contrôler et combattre la croissance microbienne. L'accent est mis sur la pathogénicité microbienne, en soulignant comment les interactions entre les microbes et le système immunitaire humain contribuent à la santé et aux maladies humaines. Les derniers chapitres du texte fournissent une étude de la microbiologie médicale, présentant les caractéristiques des maladies microbiennes organisées par système corporel.

Fichiers accessibles avec reconnaissance optique de caractères (OCR) et marquage automatique fournis par le Center for Inclusive Design and Innovation.


Notes sur les microbes | Notes de microbiologie et de biologie

Microbe Notes est une application/site Web de niche pédagogique lié à la microbiologie (bactériologie, virologie, parasitologie, mycologie, immunologie, etc.) et à différentes branches de la biologie dans le but de fournir des notes d'étude aux étudiants de premier cycle et des cycles supérieurs. Cette application est également utile pour la biologie de niveau A, la biologie AP, la biologie IB et d'autres cours de biologie et de microbiologie de niveau universitaire (B.Sc, M.Sc., M.Phil. et Ph.D.).

Caractéristiques
- 1100+ notes d'étude
- Notes mises à jour quotidiennement
- Accès gratuit à toutes les notes
- Enregistrer des notes pour une utilisation hors ligne
- Remarques de recherche

Catégories de notes :
Microbiologie agricole, bactériologie, microbiologie de base, test biochimique, test biochimique des bactéries, biochimie, bioinformatique, biologie, biotechnologie, biologie du cancer, biologie cellulaire, milieux de culture, biologie du développement, différence entre, maladies, microbiologie environnementale, épidémiologie, microbiologie alimentaire, génétique , anatomie et physiologie humaines, immunologie, infection, instrumentation, test de laboratoire, images de microbiologie, microscopie, biologie moléculaire, mycologie, parasitologie, pharmacologie, protocoles, rapport et directives, méthodologie de recherche, questions à réponse courte, coloration, virologie et programme.


Manuel de microbiologie, QCM et banque de tests

La microbiologie couvre la portée et les exigences de séquence d'un cours de microbiologie d'un semestre pour les non-majors. Le livre présente les concepts de base de la microbiologie en mettant l'accent sur les candidatures à des carrières dans le domaine de la santé paramédicale. Les caractéristiques pédagogiques du texte rendent le matériel intéressant et accessible tout en conservant l'orientation vers la candidature à la carrière et la rigueur scientifique inhérente au sujet. Le programme d'art de la microbiologie améliore la compréhension des concepts par les étudiants grâce à des illustrations, des diagrammes et des photographies clairs et efficaces.

* Manuel complet par OpenStax
* Questions à choix multiples (QCM)
* Questions à dissertation Cartes Flash
* Cartes Flash de termes-clés

Propulsé par QuizOver.com le principal créateur de quiz en ligne
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1. Un monde invisible
1.1. Ce que nos ancêtres savaient
1.2. Une approche systématique
1.3. Types de micro-organismes
2. Comment nous voyons le monde invisible
2.1. Les propriétés de la lumière
2.2. Regarder dans le monde invisible
2.3. Instruments de Microscopie
2.4. Coloration d'échantillons microscopiques
3. La cellule
3.1. Génération spontanée
3.2. Fondements de la théorie cellulaire moderne
3.3. Caractéristiques uniques des cellules procaryotes
3.4. Caractéristiques uniques des cellules eucaryotes
4. Diversité procaryote

4.1. Habitats, relations et microbiomes des procaryotes
4.2. Protéobactéries
4.3. Bactéries Gram-négatives non protéobactéries et bactéries phototrophes
4.4. Bactéries Gram-positives
4.5. Bactéries profondément ramifiées
4.6. Archées
5. Les eucaryotes de la microbiologie

5.1. Parasites eucaryotes unicellulaires
5.2. Helminthes parasites
5.3. Champignons
5.4. Algues
5.5. Lichens
6. Pathogènes acellulaires

6.1. Virus
6.2. Le cycle de vie viral
6.3. Isolement, culture et identification des virus
6.4. Viroïdes, Virusoïdes et Prions
7. Biochimie microbienne

7.1. Molécules organiques
7.2. Les glucides
7.3. Lipides
7.4. Protéines
7.5. Utiliser la biochimie pour identifier les micro-organismes
8. Métabolisme microbien

8.1. Énergie, matière et enzymes
8.2. Catabolisme des glucides
8.3. Respiration cellulaire
8.4. Fermentation
8.5. Catabolisme des lipides et des protéines
8.6. Photosynthèse
8.7. Cycles biogéochimiques
9. Croissance microbienne

9.1. Comment les microbes se développent
9.2. Besoins en oxygène pour la croissance microbienne
9.3. Les effets du pH sur la croissance microbienne
9.4. Température et croissance microbienne
9.5. Autres conditions environnementales qui affectent la croissance
9.6. Milieux utilisés pour la croissance bactérienne
10. Biochimie du génome

10.1. Utiliser la microbiologie pour découvrir les secrets de la vie
10.2. Structure et fonction de l'ADN
10.3. Structure et fonction de l'ARN
10.4. Structure et fonction des génomes cellulaires
11. Mécanismes de la génétique microbienne

11.1. Les fonctions du matériel génétique
11.2. Réplication de l'ADN
11.3. Transcription d'ARN
11.4. Synthèse de protéines (Traduction)
11.5. Mutation
11.6. Comment les procaryotes asexués parviennent à la diversité génétique
11.7. Régulation des gènes : théorie de l'opéron
12. Applications modernes de la génétique microbienne

12.1. Les microbes et les outils du génie génétique
12.2. Visualisation et caractérisation de l'ADN, de l'ARN et des protéines
12.3. Méthodes du génome entier et applications pharmaceutiques du génie génétique
12.4. Thérapie génique
13. Contrôle de la croissance microbienne
14. Médicaments antimicrobiens
15. Mécanismes microbiens de pathogénicité
16. Maladie et épidémiologie
17. Défenses innées non spécifiques de l'hôte
18. Défenses adaptatives spécifiques à l'hôte
19. Maladies du système immunitaire
20. Analyse en laboratoire de la réponse immunitaire
21. Infections de la peau et des yeux
22. Infections du système respiratoire
23. Infections du système urogénital
24. Infections du système digestif
25. Infections du système circulatoire et lymphatique
26. Infections du système nerveux


Ce cours initie les étudiants aux micro-organismes présents dans la nature, l'industrie et les maladies. Les sujets abordés comprennent la virologie, la bactériologie, l'immunologie, l'épidémiologie, la pathologie et d'autres domaines connexes de la physiologie microbienne. Le laboratoire s'occupera de l'isolement et de l'identification d'organismes pathogènes et non pathogènes courants en utilisant des techniques de coloration, de culture, de réactions de fermentation et d'inspection microscopique. Les séances de laboratoire renforceront et mettront l'accent sur le matériel de cours. Prérequis : SCB202 ou SCB204 ou SCB209. 4 crédits 6 heures (3 cours, 3 travaux pratiques)

Certains des liens nécessitent des informations de connexion et sont accessibles via MyLaGuardia.


Voir la vidéo: Openstax Microbiology Banhi Lecture Ch#15 First part (Août 2022).