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14 : Module 14- Virus, bactéries et épidémiologie - Biologie

14 : Module 14- Virus, bactéries et épidémiologie - Biologie



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14 : Module 14- Virus, bactéries et épidémiologie

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Analyse métagénomique des virus dans les selles provenant d'épidémies non résolues de gastro-entérite chez l'homme

L'étiologie d'une épidémie de gastro-entérite chez l'homme ne peut pas toujours être déterminée, et ∼25% des épidémies restent non résolues en Nouvelle-Zélande. Il est supposé que les nouveaux virus peuvent représenter une proportion des cas non résolus, et de nouvelles méthodes de séquençage à haut débit impartiales sont prometteuses pour leur détection. L'analyse du métagénome fécal peut révéler la présence de virus, de bactéries et de parasites qui peuvent avoir échappé aux tests de diagnostic de routine. Trente et un échantillons de selles provenant de 26 épidémies de gastro-entérite d'étiologie inconnue survenues en Nouvelle-Zélande entre 2011 et 2012 ont été sélectionnés pour une analyse métagénomique de novo. Un ensemble de données total de 193 millions de lectures de séquences d'une longueur de 150 pb a été produit sur un Illumina MiSeq. L'ensemble de données métagénomiques a été recherché pour les séquences de virus et de parasites, sans aucune preuve de nouveaux agents pathogènes trouvés. Huit virus et un parasite ont été détectés, chacun déjà connu pour être associé à la gastro-entérite, y compris l'adénovirus, le rotavirus, le sapovirus et le Dientamoeba fragilis. De plus, nous décrivons également la première détection du parechovirus humain 3 (HPeV3) en Australasie. La métagénomique peut donc fournir un outil d'audit utile lorsqu'elle est appliquée rétrospectivement pour déterminer où les processus de diagnostic de routine peuvent avoir échoué à détecter un agent pathogène.

Copyright © 2015, Société américaine de microbiologie. Tous les droits sont réservés.

Les figures

Analyse phylogénétique montrant la génétique…

Analyse phylogénétique montrant la parenté génétique du nucléotide partiel de la protéine virale 1 (VP1)…


Dimensions sociales des maladies infectieuses

Risque et vulnérabilité

L'épidémiologie traditionnelle des maladies infectieuses s'est concentrée, dans une large mesure, sur des facteurs de risque biologiques et comportementaux mesurables au niveau de l'individu. Dans la perspective de « l'épidémiologie des facteurs de risque », les épidémiologistes concentrent leur travail analytique sur les facteurs de risque immédiats au niveau individuel. Les chercheurs en sciences sociales, d'autre part, ont un intérêt particulier à élucider le contexte social du risque et de la vulnérabilité aux maladies infectieuses.

Les facteurs de risque comportementaux immédiats qui façonnent l'infection, l'occurrence et la gravité de la maladie comprennent les comportements individuels et de groupe liés, par exemple, à l'hygiène et à l'assainissement, au comportement sexuel, à la consommation alimentaire ou aux déplacements (y compris les voyages, les migrations et les déplacements). Les sociologues mettent l'accent sur la « logique culturelle » qui sous-tend le comportement individuel et soutiennent que les modèles de comportement, et, par conséquent, l'exposition et la répartition des risques de maladies infectieuses, sont l'expression de forces à plus grande échelle telles que la pauvreté, les inégalités sociales, les conflits armés et d'autres formes de forces sociales, économiques et politiques. Pour les spécialistes des sciences sociales, des notions de base telles que « groupe à risque », « observance du patient » et « communauté » ne saisissent pas de manière adéquate la réalité sociale, culturelle et économique complexe des populations. Par conséquent, dans la littérature en sciences sociales, la construction sociale de la vulnérabilité a largement remplacé la construction épidémiologique du « risque », fournissant une base théorique pour des interventions pratiques qui tentent de prendre en compte la manière dont des contextes sociaux spécifiques influencent les constructions identitaires individuelles, tout en évitant les risque de discrimination de groupe.

La vulnérabilité aux maladies infectieuses résulte de plusieurs facteurs majeurs qui se chevauchent, notamment des facteurs socioéconomiques, biologiques et environnementaux. Les processus sociaux au niveau macro tels que la mondialisation et la libéralisation du commerce, l'urbanisation rapide non planifiée, la pauvreté généralisée et les inégalités conduisent à la vulnérabilité des sous-groupes de population.


Virus et bactéries dans l'étiologie du rhume

Deux cents jeunes adultes atteints de rhume ont été étudiés pendant une période de 10 mois. La culture du virus, la détection de l'antigène, la PCR et la sérologie avec des échantillons appariés ont été utilisées pour identifier l'infection. L'étiologie virale a été établie pour 138 des 200 patients (69 %). Des rhinovirus ont été détectés chez 105 patients, une infection au coronavirus OC43 ou 229E a été détectée chez 17, le virus de la grippe A ou B a été détecté chez 12, et des infections uniques par le virus parainfluenza, le virus respiratoire syncytial, l'adénovirus et l'entérovirus ont été trouvées chez 14 patients. Des signes d'infection bactérienne ont été trouvés chez sept patients. Quatre patients avaient une augmentation des anticorps contre Chlamydia pneumoniae, un avait une augmentation des anticorps contre Haemophilus influenzae, un avait une augmentation des anticorps contre Streptococcus pneumoniae et un avait des anticorps immunoglobulines M contre Mycoplasma pneumoniae. Les résultats montrent que bien qu'environ 50 % des épisodes de rhume banal soient dus à des rhinovirus, l'étiologie peut varier en fonction de la situation épidémiologique en ce qui concerne les virus circulants. Les infections bactériennes étaient rares, soutenant l'idée que le rhume est presque exclusivement une maladie virale.

Les figures

(a) Occurrence mensuelle de…

(a) Fréquence mensuelle des infections virales confirmées (virus positif) et nombre total de…


La virosphère à ADN double brin en tant que réseau hiérarchique modulaire de partage de gènes

Les génomes de virus sont sujets à une perte, un gain et un échange de gènes importants et ne partagent aucun gène universel. Par conséquent, dans une étude à grande échelle de l'évolution du virus, les analyses de réseaux de gènes et de génomes peuvent compléter la phylogénétique traditionnelle. Nous avons effectué une analyse comparative exhaustive des génomes de virus à ADN double brin (ADNdb) en utilisant l'approche de réseau bipartite et avons trouvé une modularité hiérarchique robuste dans la virosphère d'ADNdb. Les réseaux bipartites se composent de deux classes de nœuds, avec des nœuds dans une classe, dans ce cas des génomes, étant connectés via des nœuds de la deuxième classe, dans ce cas des gènes. Un tel réseau peut être partitionné en modules qui combinent des nœuds des deux classes. Le réseau bipartite de virus à ADNdb comprend 19 modules qui forment 5 supermodules majeurs et 3 supermodules mineurs. Parmi ces modules, 11 comprennent des bactériophages à queue, reflétant la diversité de ce plus grand groupe de virus. L'analyse du module valide et affine quantitativement les relations évolutives non triviales proposées précédemment. Un supermodule expansif combine les virus volumineux et géants de l'ordre putatif "Megavirales" avec divers virus de taille modérée et éléments mobiles associés. Tous les virus de ce supermodule partagent une trousse à outils morphogénétique distincte avec une protéine de capside majeure à double rouleau de gelée. Les herpèsvirus et les bactériophages à queue comprennent un autre supermodule, maintenu ensemble par un ensemble distinct de protéines morphogénétiques centrées sur la protéine de capside majeure de type HK97. Ensemble, ces deux supermodules couvrent la grande majorité des virus à ADNdb actuellement connus. Nous identifions formellement un ensemble de 14 gènes viraux caractéristiques qui constituent les hubs du réseau et représentent la plupart des connexions intermodules.

Importance: Les virus et les éléments génétiques mobiles associés sont les entités biologiques dominantes sur terre, mais leur évolution n'est pas suffisamment comprise et leur classification n'est pas suffisamment développée. La raison principale est le taux élevé caractéristique d'évolution du virus qui implique non seulement un changement de séquence, mais également une perte, un gain et un échange étendus de gènes. Par conséquent, dans l'étude de l'évolution du virus à grande échelle, les approches phylogénétiques traditionnelles ont une applicabilité limitée et doivent être complétées par des analyses de réseaux de gènes et de génomes. Nous avons appliqué des méthodes de pointe d'une telle analyse pour révéler une modularité hiérarchique robuste dans les génomes des virus à ADN double brin. Certains des modules identifiés combinent des virus très divers infectant des bactéries, des archées et des eucaryotes, à l'appui des hypothèses précédentes sur les relations évolutives directes entre les virus des trois domaines de la vie cellulaire. Nous identifions formellement un ensemble de 14 gènes viraux caractéristiques qui maintiennent ensemble le réseau génomique.

Copyright © 2016 Iranzo et al.

Les figures

Le monde du virus dsDNA en tant que réseau bipartite. Les nœuds correspondant aux génomes sont…

Structure noyau-coquille-nuage du gène viral…

Structure noyau-coquille-nuage des familles de gènes viraux. Pour chaque bac, la barre indique le…

Robustesse et similarité croisée des modules…

Robustesse et similarité croisée des modules dans le réseau bipartite de virus. (A et B)…

Structure d'ordre supérieur du virus…

Structure d'ordre supérieur du réseau de virus. (A) Réseau bipartite défini par des modules (numérotés…

La structure interne du…

La structure interne du supermodule PL-« Megavirales ». Un module est lié à un…

Structure interne du Caudovirales…

Structure interne du Caudovirales supermodule. Un module est relié à un connecteur…

Caractérisation des gènes viraux caractéristiques…

Caractérisation des gènes viraux de marque et des gènes de signature spécifiques au module. (A) Tous les gènes de base…


Deux principaux types d'agents pathogènes peuvent vous infecter :

  1. Pathogènes facultatifs. Ce type d'agent pathogène peut se reproduire chez un hôte ou ailleurs, comme sur une surface de votre maison.
  2. Agents pathogènes obligatoires. Ces micro-organismes ne peuvent se reproduire que chez un hôte. Tous les virus entrent dans cette catégorie car ils ne peuvent pas se reproduire seuls comme les bactéries ou les champignons.

De plus, certains agents pathogènes nécessitent plusieurs hôtes. Par exemple, les tiques du chevreuil sont infectées par la maladie de Lyme, qu'elles peuvent ensuite vous transmettre.

Certains agents pathogènes ne peuvent survivre que dans un seul type d'hôte. D'autres agents pathogènes peuvent infecter un large éventail d'organismes. Par exemple, des tigres et des primates dans les zoos ont attrapé le virus COVID-19 après être entrés en contact avec leurs soignants humains. La grippe aviaire et la grippe porcine sont deux autres virus qui ont à la fois des animaux et des humains comme hôtes. Les agents pathogènes qui peuvent se transmettre des animaux aux humains sont appelés maladies zoonotiques.


Brock biologie des micro-organismes

"Brock Biology of Microorganisms, le manuel n°1 faisant autorité pour l'introduction à la microbiologie, continue d'établir la norme en matière d'érudition impeccable, d'exactitude et d'illustrations et de photos exceptionnelles. Ce livre pour la biologie, la microbiologie et d'autres disciplines scientifiques équilibre la recherche de pointe avec les concepts essentiel pour comprendre le domaine de la microbiologie.En plus d'un nouveau co-auteur, David Stahl, qui apporte une couverture de la recherche de pointe en écologie microbienne et de la symbiose à un tout nouveau chapitre (chapitre 25), un chapitre de présentation entièrement révisé sur l'immunologie (chapitre 28), une nouvelle section "Grandes idées" à la fin de chaque chapitre, et une multitude de nouvelles photos et illustrations rendent la treizième édition meilleure que jamais. Brock Biology of Microorganisms s'adresse aux étudiants d'aujourd'hui tout en maintenant la profondeur et la précision dont les majors scientifiques ont besoin ."--Site de l'éditeur

"Trois nouveaux chapitres se concentrent sur les domaines en développement rapide de la biologie moléculaire des archées et des eucaryotes, de la biotechnologie et de l'immunologie dans la défense et la maladie de l'hôte"--Page viii

Édition révisée de : Brock biologie des microorganismes / Michael T. Madigan. 11e éd. 2006

Comprend des références bibliographiques et un index

Microorganismes et microbiologie -- Un bref voyage dans le monde microbien -- Chimie des composants cellulaires -- Structure et fonction cellulaires chez les bactéries et les archées -- Nutrition, culture et métabolisme des micro-organismes -- Croissance microbienne -- Bases de la biologie moléculaire -- Biologie moléculaire archéenne et eucaryote -- Régulation de l'expression des gènes -- Panorama des virus et de la virologie -- Principes de génétique bactérienne -- Génie génétique -- Génomique microbienne -- Évolution et systématique microbienne -- Bactéries : les protéobactéries -- Bactéries : gram- bactéries positives et autres -- Archaea -- Biologie cellulaire eucaryote et microorganismes eucaryotes -- Diversité virale -- Diversité métabolique : phototrophie, autotrophie, chimiolithotrophie et fixation d'azote -- Diversité métabolique : catabolisme des composés organiques -- Méthodes en écologie microbienne -- Écosystèmes microbiens -- Cycles des nutriments, bioremédiation et symbioses -- Microbiologie industrielle -- Biotechnologie -- Contrôle de la croissance microbienne l -- Interactions microbiennes avec l'homme -- Fondamentaux de l'immunologie -- Immunologie dans la défense et la maladie de l'hôte -- Immunologie moléculaire -- Microbiologie et immunologie diagnostiques -- Epidémiologie -- Maladies microbiennes interhumaines -- Maladies microbiennes transmises par les vecteurs et le sol - - Traitement des eaux usées, purification de l'eau et maladies microbiennes d'origine hydrique -- Conservation des aliments et maladies microbiennes d'origine alimentaire

Access-restricted-item true Addeddate 2021-02-02 04:09:17 Associated-names Madigan, Michael T., 1949- Madigan, Michael T., 1949- Biology of microorganisms Brock, Thomas D. Biology of microorganisms Boxid IA40053315 Camera USB PTP Class Camera Collection_set printdisabled Identifiant externe urn:oclc:record:1244508041 Foldoutcount 0 Identifiant brockbiologyofmi0000unse Identifiant-ark ark:/13960/t3gz4d26w Facture 1652 Isbn 0132324601
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Maladies émergentes

Les définitions de l'EID varient, y compris : une maladie dont l'incidence chez l'homme a augmenté une maladie qui a tendance à se propager géographiquement, provoquer une incidence accrue, ou infecter une nouvelle espèce ou de nouvelles populations ou, une maladie se propageant au sein d'une population hôte (24& #x0201326). Les agents pathogènes peuvent également être considérés comme émergents, par exemple les bactéries résistantes aux antimicrobiens. Ces définitions peuvent être appliquées de la même manière aux maladies de la faune et des plantes (27, 28), dans les écosystèmes terrestres et marins (29). Il peut également y avoir une apparente émergence de maladies nouvellement découvertes ou sous-diagnostiquées (24, 26, 30).

Taylor et al. (31) ont constaté que les virus et les protozoaires présentaient les proportions les plus élevées d'agents pathogènes émergents. Les agents pathogènes zoonotiques ont été trouvés deux fois plus susceptibles d'émerger que les agents non zoonotiques, mais cela n'a été observé que chez certains taxons (bactéries et champignons). Le saut d'hôte survenant lors d'une infection zoonotique peut soit provoquer l'établissement de l'agent pathogène dans la nouvelle population avec une propagation ultérieure, soit il peut y avoir des événements récurrents de transmission d'un réservoir au nouvel hôte, après quoi aucune autre transmission ne se produit, ou il y a un petite épidémie limitée (32). La prédominance des infections zoonotiques parmi les menaces sanitaires émergentes a également été démontrée parmi les événements récents d'importance pour la santé publique dans les Amériques, où 70 % des événements étaient causés par des agents zoonotiques (33).

Certaines régions du monde, les ‘points chauds’, ont tendance à avoir plus d'événements d'EID (20, 34). Ceux-ci ont souvent une intensification rapide des systèmes agricoles, en particulier de l'élevage, et des interactions croissantes entre les animaux, les humains et les écosystèmes, souvent causées par l'évolution rapide des habitudes et des pratiques au sein des sociétés (18, 35). Tout aussi importants du point de vue de la santé publique peuvent être les « points froids » ; les endroits négligés où les mesures de santé publique ne sont pas efficaces et les maladies qui sont contrôlées ailleurs prospèrent encore (18) et peuvent constituer un réservoir de maladies pour de futurs re- émergence.

En particulier, les petits agriculteurs ou les agriculteurs de basse-cour peuvent être affectés de manière disproportionnée par les impacts négatifs de l'EID (36). Les maladies émergentes, telles que la grippe aviaire hautement pathogène, peuvent entraîner un déclin ou une restructuration de l'industrie avec des effets négatifs sur les petits producteurs et les acteurs de la chaîne de valeur (37).

McMichael (38) a proposé cinq catégories de promoteurs pour les infections émergentes : l'utilisation des terres et les changements environnementaux les changements démographiques les conditions de l'hôte le comportement de consommation humaine et d'autres comportements tels que les interactions sociales et culturelles, les habitudes sexuelles et la consommation de drogues. En dehors de ceux-ci, des facteurs au sein de l'agent pathogène, tels que la capacité d'évoluer à travers des mutations, sont importants pour l'émergence de la maladie (39).

Pathogènes

Virus

Les EID qui ont reçu le plus de publicité au cours des dernières décennies sont les virus. Des exemples notables ont été le VIH, le SRAS et Ebola. On estime que 44 % des maladies considérées comme émergentes chez l'homme sont virales (31).

Les virus à ARN sont sujets à l'émergence en raison de leur réplication rapide et de leurs taux de mutation élevés, avec environ une erreur de lecture par réplication, et de grandes populations virales (40, 41). Cependant, la pression évolutive accrue de devoir s'adapter à la fois aux hôtes invertébrés et vertébrés crée un taux de mutation plus faible dans les virus à transmission vectorielle, et la plupart de leurs mutations sont synonymes (42).

Outre les mutations ponctuelles, les virus peuvent évoluer par des événements de recombinaison, en particulier parmi les virus segmentés. Le réassortiment qui se produit dans les virus de la grippe en est un exemple par lequel les virus de la grippe créent de nouvelles combinaisons de gènes. Les virus simple brin peuvent également se recombiner lorsque différentes souches virales circulent dans la même zone et infectent occasionnellement la même cellule, comme dans l'exemple du virus de l'encéphalite japonaise (43, 44). Cependant, malgré la tendance accrue aux recombinaisons parmi les virus segmentés, les virus à ARN simple brin semblent être surreprésentés parmi les agents pathogènes émergents (32).

Bactéries

Les bactéries et les rickettsies constituent 38 % des agents pathogènes humains et 30 % des agents pathogènes émergents chez l'homme (31). En raison de l'échec ou de la complaisance de la santé publique, de nombreuses maladies bactériennes ont réapparu, comme le choléra et la peste en Inde (45). L'un des phénomènes les plus alarmants chez les bactéries est la propagation de la résistance aux antibiotiques. Bien que les bactéries aient une évolution continue avec des mutations, elles ont également des moyens de diffuser leur matériel génétique latéralement entre les espèces grâce à l'échange de plasmides ou d'intégrons (46&# x0201349). Cette capacité à partager du matériel génétique n'est pas un phénomène limité à la résistance aux antibiotiques, mais un moyen efficace de gérer également différentes circonstances environnementales défavorables dans la nature (49, 50). De la même manière, un transfert latéral peut se produire des gènes de virulence (48), et l'intégration des éléments du gène de la toxine à partir des phages semble se produire couramment dans Escherichia coli, bien que les toxines ne soient pas toujours exprimées dans la même quantité (26).

La plupart des études semblent montrer que l'acquisition de gènes de résistance aux antimicrobiens chez les bactéries entraîne un désavantage comparatif par rapport aux bactéries non résistantes en l'absence d'antibiotiques, mais les études de certains gènes n'ont montré aucune différence, voire l'inverse. Une évolution plus longue associée à un gène de résistance peut réduire les coûts pour les bactéries (51).

Champignons

Les infections fongiques apparaissent non seulement parmi les plantes, où elles ont longtemps été une cause importante de pertes, mais aussi parmi les poissons, les coraux, les amphibiens, les chauves-souris et les humains (52). En fait, les infections fongiques contribuent à la majorité des événements d'extinction connus pour avoir été causés par des maladies infectieuses (52, 53). Cela peut être dû au fait que les champignons peuvent effectivement infecter 100 % d'une population, avant qu'elle ne soit tuée par la mortalité élevée. De nombreux champignons ont en outre la possibilité de persister sous forme de spores libres (52).

En plus des champignons qui infectent directement les humains et les animaux, les champignons qui produisent des toxines peuvent provoquer des maladies indirectement. Les fumonisines et les aflatoxines sont des toxines produites par différentes moisissures, principalement Fusarium et Aspergillus espèces, et la croissance de ces champignons est favorisée par les circonstances climatiques et les mauvaises conditions de stockage (54, 55). Les toxines ont de graves effets sur la santé des humains et des animaux, et les coûts des maladies et des cultures condamnées sont élevés (56, 57). Les changements climatiques sont susceptibles d'affecter davantage l'impact (58).

Parasites

Même si une partie de l'augmentation des déclarations de maladies parasitaires peut être due à une sous-déclaration antérieure, l'incidence semble augmenter. De grandes parties des pays industrialisés ont réussi à réduire le fardeau de nombreux parasites, alors que dans de nombreux pays, les infections chroniques multiples sont courantes (59). La plupart des infections helminthiques (95 %) sont zoonotiques, et des infections à protozoaires chez l'homme, à la fois zoonotiques et non zoonotiques, sont susceptibles d'émerger (31). Un problème émergent chez les parasites est l'augmentation de la résistance, qui rend de nombreux médicaments inefficaces (60).

Prions

Dans l'analyse de Taylor et al. (31) sur les agents pathogènes humains, l'agent causal de l'encéphalopathie spongiforme bovine était le seul prion répertorié, classé à la fois zoonotique et émergent. Il existe cependant d'autres infections importantes chez les animaux. La maladie débilitante chronique chez les cervidés se propage en Amérique du Nord et affecte les populations de cervidés, mais on pense qu'elle a un faible potentiel zoonotique (61). De nouvelles souches de tremblante atypique chez le mouton et la détection d'autres nouvelles encéphalopathies spongiformes transmissibles ont également suscité des inquiétudes accrues, tant pour l'émergence au sein des populations animales que pour leurs éventuelles implications zoonotiques (62).

Voies de transmission

Les infections transmises directement entre individus dépendent du taux de contact entre personnes sensibles et contagieuses, et donc par la suite de la densité de population et du brassage des populations. La transmission directe des zoonoses nécessite un contact entre les animaux hôtes et les humains, comme dans le cas de la transmission de la rage, mais la transmission peut également se produire dans l'autre sens. Un contact étroit augmente le risque de transmission des animaux de compagnie ou du bétail à leurs propriétaires, et la demande croissante d'animaux de compagnie exotiques (63) avec l'augmentation du commerce qui s'ensuit augmente encore le risque d'introduction de nouveaux agents pathogènes. Les agents pathogènes d'origine alimentaire et hydrique sont la principale contribution aux milliards de cas de diarrhée annuels qui surviennent (18). L'augmentation de la transmission d'origine alimentaire peut être un effet des difficultés à manipuler le fumier provenant de la production animale en toute sécurité, car cela peut être une source de nombreux agents pathogènes zoonotiques (64). C'est un problème à la fois pour l'agriculture à petite échelle où il peut n'y avoir aucun système pour traiter le fumier, et dans les systèmes industrialisés où la grande quantité de fumier produite quotidiennement pose des problèmes de gestion. En outre, l'augmentation de la pénurie d'eau et de la pollution de l'eau à l'avenir (65) peut entraîner des risques accrus de diminution de la sécurité alimentaire.

Les maladies à transmission vectorielle constituent environ 23 % des infections considérées comme émergentes (20). Bien que les arbovirus puissent être transmis par un large éventail d'arthropodes, les moustiques sont les plus importants d'un point de vue vétérinaire et médical et peuvent avoir parasité le sang des mammifères pendant 100 millions d'années (66). Les maladies causées par des agents pathogènes à transmission vectorielle se produisent souvent sous forme d'événements de débordement, car les agents pathogènes circulent généralement entre les hôtes réservoirs et les vecteurs invertébrés sans provoquer de maladie apparente. Cependant, de nombreux vecteurs ne sont pas spécifiques dans leurs exigences vis-à-vis de leurs hôtes qui se nourrissent et peuvent se nourrir d'autres animaux. Ces vecteurs opportunistes et oligophiles peuvent ainsi transférer un agent pathogène d'un hôte réservoir aux animaux ou aux humains où la maladie survient. Souvent, ces nouveaux hôtes accidentels sont moins capables d'amplifier l'agent pathogène et constituent des impasses épidémiologiques.

La nature complexe de la transmission vectorielle rend difficile de prédire comment les changements affecteront l'incidence. La température affecte à la fois la longévité, la période d'incubation au sein du vecteur, l'abondance, le comportement et les cycles de reproduction du moustique et, par conséquent, des climats plus chauds peuvent entraîner à la fois une augmentation de la transmission et une réduction, lorsque la durée de vie du moustique est réduite en deçà du temps. requis pour que le virus se réplique (67). L'essence est que tous les facteurs qui contribuent à des périodes d'incubation plus courtes, à une abondance accrue de moustiques, à une proportion accrue d'hôtes appropriés ou à une survie accrue des vecteurs augmenteront la transmission de la maladie.

Le comportement opportuniste de nombreux vecteurs peut les amener à modifier leur alimentation en fonction de la disponibilité de l'hôte, et même les moustiques ayant une forte préférence pour l'homme se nourriront d'autres hôtes s'ils sont suffisamment abondants (68). La présence de plusieurs espèces peut, en théorie, avoir à la fois un effet de dilution, où l'alimentation sur d'autres espèces diminue la proportion de vecteurs se nourrissant de l'espèce cible pour une maladie, et un effet amplificateur où l'accès à plusieurs hôtes d'alimentation provoque une augmentation de l'abondance de vecteurs (69). L'effet de dilution d'autres animaux a été utilisé en zooprophylaxie, lorsqu'une espèce, souvent du bétail, est utilisée pour détourner les moustiques d'une autre espèce, mais cela ne fonctionne pas si l'abondance du vecteur est augmentée (68).

Dynamique des agents pathogènes

Le concept de Susceptible-Infected&# x02013Removed (SIR) a été utilisé pour modéliser les maladies infectieuses depuis qu'il a été proposé dans les années 1920. Le modèle est cependant simplifié et pour une modélisation plus appropriée, il peut être nécessaire d'inclure une catégorie d'exposition et d'infection latente (70).

En général, la propagation des maladies infectieuses est favorisée par tous les facteurs qui augmentent le taux de contact, en particulier entre les individus sensibles et infectés, créent des individus plus sensibles et augmentent le temps de contagiosité (71). Les actions provoquant le contraire réduiront ainsi la propagation. Il y a souvent plusieurs étapes avant qu'une action entreprise par l'homme ne se transforme en un risque accru de maladie, ce qui peut entraîner une augmentation retardée de l'incidence (Fig. 1). Parce que la dynamique de la maladie du SIR est essentielle et fondamentale à l'épidémiologie des humains, des animaux et des plantes, tous les facteurs proposés par la littérature sont répertoriés ici en fonction de leur effet sur ces catégories. Ainsi, aux fins de ce cadre, les facteurs : 1) l'augmentation du nombre d'individus sensibles, 2) l'augmentation des risques d'exposition, et 3) l'augmentation du degré de contagiosité de l'individu infecté, sont considérés comme des facteurs augmentant les risques d'émergence de la maladie.


Liste des 9 maladies virales importantes | Maladies | Santé humaine | La biologie

Liste de neuf maladies virales importantes observées chez l'homme : 1. La varicelle 2. La variole 3. La poliomyélite 4. La rougeole 5. Les oreillons 6. La rage 7. Le trachome 8. La grippe 9. L'hépatite.

Maladie virale # 1. La varicelle (varicelle) :

Pathogène – Herpes-zoster virus (ADN-virus)

Épidémiologie – Contagieuse et formite transmise

Période d'incubation – 12-20 jours

Symptômes – Éruption cutanée ou variole de couleur rouge foncé se transformant en vésicules, croûtes et chute.

Prophylaxie – Vaccin maintenant disponible, isolement.

Thérapie – Immunoglobulines contre le zona (ZIG).

Maladie virale # 2. Variole (variole) :

Pathogène – Variola-virus (ADN-Virus)

Épidémiologie – Contagieuse et infection par gouttelettes

Période d'incubation – 12 jours

Symptômes – Apparition d'une éruption cutanée se transformant en pustules, en croûtes et en chute.

Prophylaxie – Vaccin contre la variole.

Thérapie – Aucun cas signalé après 1978.

Maladie virale # 3. Poliomyélite :

Pathogène – Polio-virus (ARN-virus)

Épidémiologie – Direct et oral

Période d'incubation – 7-14 jours

Symptômes – Endommage les motoneurones provoquant une raideur de la nuque, des convulsions, une paralysie des jambes en général.

Vaccin prophylactique – ‘Salk’ et vaccin oral contre la polio.

Maladie virale # 4. Rougeole (rubéole-maladie) :

Pathogène – Rubeolla-virus (ARN-virus)

Épidémiologie – Contagieuse et infection par gouttelettes

Période d'incubation – 10 jours

Symptômes – Rubeolla (éruptions cutanées), toux, éternuements, etc.

Prophylaxie – Edmonston-vaccin B, isolement

Thérapie – Antibiotiques et médicaments sulfatés.

Maladie virale # 5. Oreillons :

Pathogène – virus des oreillons (virus à ARN)

Épidémiologie – Contagieuse et infection par gouttelettes

Période d'incubation – 12-26 jours

Symptômes – Hypertrophie douloureuse des glandes salivaires parotides.

Prophylaxie – - Isolement du vaccin contre les oreillons

Maladie virale # 6. Rage (hydrophobie) :

Agent pathogène – Virus de la rage (virus à ARN)

Épidémiologie – Inoculation indirecte et amplifiée (les vecteurs sont des singes, des chats, des chiens enragés)

Période d'incubation – 10 jours à 1 à 3 mois

Symptômes – Spasme des muscles de la gorge et de la poitrine, peur de l'eau, paralysie et mort.

Prophylaxie – Immunisation des chiens.

Thérapie – Pasteur- traitement (14 vaccins dans l'estomac).

Maladie virale # 7. Trachome :

Pathogène – Chlamydia trachomatis

Épidémiologie – Contagieux, transmis par les formites et mouches (vecteurs)

Période d'incubation – 5-12 jours

Symptômes – Inflammation de la conjonctive et de la cornée conduisant à la cécité.

Thérapie – Tétracycline & sulfonamide.

Maladie virale # 8. Grippe (Grippe) :

Pathogène – Myxovirus influenzae (virus à ARN)

Épidémiologie – Aérienne et pandémie

La période d'incubation – 24-48 heures dure 4-5 jours

Symptômes – Bronchite, éternuement bronchopneumonie, leucopénie, toux, etc.

Thérapie – Antibiothérapie.

Maladie virale # 9. Hépatite (jaunisse épidémique) :

Pathogène – Virus de l'hépatite B

Épidémiologie – Direct et oral (avec de la nourriture et de l'eau)

Période d'incubation – 20-35 jours

Symptômes – Dommages aux cellules hépatiques libérant de la bilirubine qui provoque la jaunisse.

Prophylaxie – Un assainissement adéquat une bonne couverture de la nourriture, de l'eau, du lait, etc. l'utilisation d'eau chlorée ou bouillie, etc.


Voir la vidéo: COURS SVT VIRUS BACTERIES (Août 2022).